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Nato a Würzburg in germania il 17 febbraio 1796 e morto a Monaco di Baviera il 18 ottobre 1866, fu esploratore, medico e botanico.
Nato in una famiglia di medici e professori di medicina a Würzburg. Studiò inizialmente medicina all'Università di Würzburg, dove divenne membro dell'associazione studentesca Moenania Würzburg. Si laureò in medicina e inizialmente esercitò a Heidingsfeld in Germania. Spostatosi in Olanda fece domanda per un posto da medico militare nell'esercito olandese, che gli avrebbe consentito di viaggiare nelle colonie olandesi. Fu nominato medico di bordo sulla fregata Adriana in viaggio da Rotterdam a Giacarta e nell'attuale Indonesia. Durante la lunga traversata iniziò una raccolta di fauna marina. Fu il primo europeo ad insegnare la medicina occidentale in Giappone. Ebbe grande fama per il suo studio della flora e della fauna giapponesi.
Siebold è usato per indicare questo individuo come l'autore di un nome botanico.